El proyecto del Acuario Nacional, que formaba parte del plan para el embellecimiento de Buġibba y Qawra, revisó significativamente las instalaciones disponibles en la zona al proporcionar un complejo de acuarios nacionales de alta gama.
La financiación para este proyecto provino de la Unión Europea, el Gobierno de Malta y el sector privado.
El techo inclinado del Acuario Nacional de Malta es una de sus características, con la icónica estructura curva que imita la forma de una estrella de mar.
El acuario nacional de Malta consta de veintiséis tanques de exhibición, cada uno con diferentes tipos de peces presentes en los mares mediterráneos, así como artefactos históricos presentes en los mares de Malta. Estos tanques se han dividido en cinco zonas temáticas diferentes, con cada zona que consta de diferentes características de las Islas Maltesas, el Gran Puerto, y las zonas de Gozo y Comino.
Las exhibiciones están temáticas para contar una historia de importancia cultural y conservación relacionada con las islas maltesas, mientras que los animales que llenan las exhibiciones son de ecosistemas nativos, de agua fría y marinos tropicales, así como de agua dulce. El tanque principal del acuario alberga especies de todo el mundo, incluidos tiburones de punta negra, tiburones cebra, tiburones leopardo, tiburones de bambú, así como rayas, anguilas y especies de arrecifes de coral.
Dividido en dos plantas; la planta baja consta de un restaurante y tienda de regalos, y la planta sótano está compuesta por el acuario y sus instalaciones.
Inaugurado en 2013, el Acuario Nacional de Malta ha tenido un éxito considerable. La Oficina Nacional de Auditoría de Malta informó que, entre 2014 y 2017, el número de visitantes al Acuario Nacional superó significativamente los números previstos.